Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLDN25C9JDP6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms