Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IDSB3KWA1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IDSB3KWA1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms