Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms