Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEMA6NI47 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms