Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC160A6NGH7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms