Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L4A6NCW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms