Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms