Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016168.3-201ENST00000625040 3246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBFOX1-202ENST00000340209 4099 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF880-201ENST00000344085 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 URM1-201ENST00000372847 753 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC069281.1-201ENST00000392471 570 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589763.1-201ENST00000412257 791 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL268P-201ENST00000491172 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.6-205ENST00000518619 807 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P38-201ENST00000560794 433 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010931.1-201ENST00000565063 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002551.1-201ENST00000569881 592 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016727.1-201ENST00000603652 545 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034229.3-201ENST00000606203 2436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ15-206ENST00000398932 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms