Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
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