Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158071.4-201ENST00000608358 4125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HYDIN-203ENST00000321489 3685 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FLI1-202ENST00000344954 3427 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF7-203ENST00000421199 3037 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01588-208ENST00000554129 2301 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms