Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3KBP1-203ENST00000379716 3819 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073539.1-201ENST00000599810 2094 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF599-202ENST00000587354 3476 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NECTIN4-201ENST00000368012 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms