Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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