Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 AP000553.4-201ENST00000641967 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LSM5-208ENST00000450169 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 OASL-201ENST00000257570 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AP001324.3-201ENST00000624759 1428 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UGT1A9-201ENST00000354728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CD2BP2-201ENST00000305596 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FBXL13-203ENST00000379308 2577 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NEFM-201ENST00000221166 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CNBD2-205ENST00000538900 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LAMC2-204ENST00000493293 4313 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SEZ6L2-203ENST00000350527 3173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AL078604.2-201ENST00000430078 2002 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AHI1-202ENST00000327035 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC02436-202ENST00000509017 2186 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC068448.1-201ENST00000623902 3925 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 EXD2-204ENST00000409242 2496 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 WWP2-216ENST00000569174 2474 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ICOS-201ENST00000316386 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CCDC190-203ENST00000367912 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FCRL1-201ENST00000358292 2778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LILRB2-205ENST00000434421 2773 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RFESD-203ENST00000458310 2788 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 STX12-201ENST00000373943 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 C3orf14-206ENST00000494481 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KIAA0087-201ENST00000242109 4283 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IL1RL2-203ENST00000441515 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC104852.1-201ENST00000518921 1459 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KRT34-201ENST00000394001 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ANK2-216ENST00000510275 1770 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UXS1-202ENST00000409032 1935 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SCML4-202ENST00000369021 2056 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CELF2-207ENST00000609692 2210 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms