Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC02345-202ENST00000558081 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CLN3Q13286 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CLN3Q13286 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR7A17-203ENST00000642123 3565 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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