Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A3GALT2U3KPV4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A3GALT2U3KPV4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A3GALT2U3KPV4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A3GALT2U3KPV4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A3GALT2U3KPV4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms