Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAD1L1Q9Y6D9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms