Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TPRKBQ9Y3C4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRKBQ9Y3C4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms