Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms