Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LEMD3Q9Y2U8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms