Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZMYND8Q9ULU4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZMYND8Q9ULU4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms