Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNRF3Q9ULT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms