Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAX2Q9UIW0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAX2Q9UIW0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms