Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC23A1Q9UHI7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC23A1Q9UHI7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC23A1Q9UHI7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC23A1Q9UHI7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC23A1Q9UHI7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC23A1Q9UHI7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms