Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms