Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NLE1Q9NVX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NLE1Q9NVX2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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