Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG3Q9NT62 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms