Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C19orf12Q9NSK7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms