Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELLSQ9NRZ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms