Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB18Q9NP72 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms