Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms