Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms