Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKRIP1Q9H875 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms