Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM60Q9H2L4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM60Q9H2L4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms