Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC8Q9H0W5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms