Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDGFDQ9GZP0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
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