Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms