Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTPBP4Q9BZE4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTPBP4Q9BZE4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms