Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms