Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PBDC1Q9BVG4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PBDC1Q9BVG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms