Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAMP8Q9BV40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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