Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms