Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms