Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3GL2Q99962 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3GL2Q99962 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms