Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3CQ99613 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms