Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP19Q99542 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP19Q99542 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms