Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYCBPQ99417 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms