Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMG1Q96Q15 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms