Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC7Q96M83 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms