Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM63Q969Q1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms