Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms